CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測試劑注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則(2019年第83號(hào))
發(fā)布日期:2019-12-05 閱讀量:次
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CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測試劑
注冊技術(shù)審查指導(dǎo)原則
本指導(dǎo)原則旨在指導(dǎo)注冊申請人對CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測試劑注冊申報(bào)資料的準(zhǔn)備及撰寫,同時(shí)也為技術(shù)審評(píng)部門對注冊申報(bào)資料的技術(shù)審評(píng)提供參考。
本指導(dǎo)原則是對CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測試劑的一般要求,申請人應(yīng)依據(jù)產(chǎn)品的具體特性確定其中內(nèi)容是否適用,若不適用,需具體闡述理由及相應(yīng)的科學(xué)依據(jù),并依據(jù)產(chǎn)品的具體特性對注冊申報(bào)資料的內(nèi)容進(jìn)行充實(shí)和細(xì)化。
本指導(dǎo)原則是對申請人和審查人員的指導(dǎo)性文件,但不包括注冊審批所涉及的行政事項(xiàng),也不作為法規(guī)強(qiáng)制執(zhí)行,如果有能夠滿足相關(guān)法規(guī)要求的其他方法,也可以采用,但需要提供詳細(xì)的研究資料和驗(yàn)證資料,相關(guān)人員應(yīng)在遵循相關(guān)法規(guī)的前提下使用本指導(dǎo)原則。
本指導(dǎo)原則是在現(xiàn)行法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)體系以及當(dāng)前認(rèn)知水平下制定的,隨著法規(guī)和標(biāo)準(zhǔn)的不斷完善,以及科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,本指導(dǎo)原則相關(guān)內(nèi)容也將適時(shí)進(jìn)行調(diào)整。
一、適用范圍
藥物代謝酶在藥物體內(nèi)代謝過程中起著重要作用,其活性強(qiáng)弱是藥物代謝速率的重要影響因素,直接決定了藥物作用的強(qiáng)度和持久性。人體內(nèi)的藥物代謝酶主要有細(xì)胞色素P450(CYP450)同工酶和N-乙酰轉(zhuǎn)移酶(NAT)等。CYP2C19酶是一種重要的CYP450同工酶,臨床以CYP2C19酶為主要代謝酶的藥物包括抗血小板藥物(如:氯吡格雷)和質(zhì)子泵抑制劑等。氯吡格雷是一種抗血小板藥物,廣泛用于:急性冠脈綜合征(ACS)患者,包括非ST段抬高性ACS(不穩(wěn)定性心絞痛UA或非Q波心肌梗死)和ST段抬高性心肌梗死(NSTEMI)患者,其中,非ST段抬高性ACS包括經(jīng)皮冠狀動(dòng)脈介入術(shù)后置入支架的患者;外周動(dòng)脈性疾病患者;近期心肌梗死或近期缺血性卒中患者。氯吡格雷作為一種前體藥物,本身并無藥理活性,主要經(jīng)CYP2C19酶代謝活化,產(chǎn)生活性代謝產(chǎn)物,后者與血小板表面的P2Y12受體不可逆結(jié)合,抑制血小板聚集,干擾ADP介導(dǎo)的血小板活化,發(fā)揮抗血小板效應(yīng)。
CYP2C19酶的編碼基因?yàn)镃YP2C19基因,位于人類10號(hào)染色體上。CYP2C19基因含有42個(gè)等位基因,CYP2C19*1為野生型等位基因,其編碼的酶具有正?;钚浴YP2C19*2(rs4244285,c.681G>A)和CYP2C19*3(rs4986893,c.636G>A)編碼的CYP2C19酶活性降低,是中國人群中存在的2種主要的等位基因,在中國人群的發(fā)生頻率分別為23.1%~35%和2%~7%。CYP2C19*17(rs12248560,c.-806C>T)編碼的CYP2C19酶活性增強(qiáng),在中國人群的發(fā)生頻率約為0.5%~4%。除CYP2C19*2/*3/*17之外,可能影響CYP2C19酶活性的CYP2C19等位基因還包括CYP2C19*4~CYP2C19*8等,但這些等位基因在中國人群的發(fā)生頻率低,其功能與臨床意義有待進(jìn)一步研究。
CYP2C19基因的遺傳變異導(dǎo)致CYP2C19酶活性的個(gè)體差異,使人群出現(xiàn)超快代謝者(UM)、快代謝者(EM)、中間代謝者(IM)和慢代謝者(PM)4種表型。CYP2C19 UM患者應(yīng)用常規(guī)劑量的氯吡格雷后體內(nèi)生成的活性代謝產(chǎn)物增多,對血小板的抑制作用升高,抗血小板功能增強(qiáng),出血風(fēng)險(xiǎn)增大。而CYP2C19 PM患者應(yīng)用常規(guī)劑量的氯吡格雷后體內(nèi)生成的活性代謝產(chǎn)物減少,對血小板的抑制作用下降,抗血小板功能減弱,血栓風(fēng)險(xiǎn)增大。UM個(gè)體的基因型可為CYP2C19*17/*17純合型或CYP2C19*1/*17雜合型;EM個(gè)體的基因型可為CYP2C19*1/*1純合型;IM個(gè)體的基因型可為CYP2C19*1/*2、CYP2C19*1/*3、CYP2C19*2/*17或CYP2C19*3/*17雜合型;PM個(gè)體的基因型可為CYP2C19*2/*3、CYP2C19*2/*2和CYP2C19*3/*3雜合型或純合型。
通過CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測,可將服藥人群分為上述4類氯吡格雷代謝患者,從而用于氯吡格雷的用藥指導(dǎo)。美國FDA在氯吡格雷藥物說明書中建議:對于CYP2C19 PM患者,可考慮使用其他血小板P2Y12抑制劑。遺傳藥理學(xué)知識(shí)庫以及臨床遺傳藥理學(xué)實(shí)施聯(lián)盟(CPIC)發(fā)布的CYP2C19基因型和氯吡格雷用藥指導(dǎo)文件建議:對于CYP2C19 PM患者和IM患者,可選用其它抗血小板藥物(如:普拉格雷或替格瑞洛)進(jìn)行治療。2015年,原國家衛(wèi)生計(jì)生委發(fā)布的《藥物代謝酶和藥物作用靶點(diǎn)基因檢測技術(shù)指南(試行)》也建議:對于CYP2C19 PM患者的抗血小板治療,可增加氯吡格雷的劑量或選用其他不經(jīng)CYP2C19代謝的抗血小板藥物(如替格瑞洛)等。
然而,對于哪些氯吡格雷服藥人群需進(jìn)行CYP2C19基因型檢測,國內(nèi)外尚無統(tǒng)一意見。2013年發(fā)布的《抗血小板治療中國專家共識(shí)》建議:CYP2C19基因型檢測臨床應(yīng)用價(jià)值有限,不推薦常規(guī)進(jìn)行。CPIC在隨后發(fā)布的CYP2C19基因型和氯吡格雷用藥指導(dǎo)文件中建議:基于CYP2C19基因型的氯吡格雷抗血小板治療主要用于進(jìn)行經(jīng)皮冠狀動(dòng)脈介入治療的急性冠脈綜合征患者(簡稱為ACS/PCI患者),尚無證據(jù)表明CYP2C19基因型可用于指導(dǎo)氯吡格雷在其他患者中的抗血小板治療。2014年發(fā)布的《抗血小板藥物治療反應(yīng)多樣性臨床檢測和處理的中國專家建議》建議:不推薦常規(guī)進(jìn)行CYP2C19基因型檢測,僅對PCI術(shù)后血栓高危、且計(jì)劃調(diào)整P2Y12抑制劑治療方案的患者,推薦進(jìn)行血小板功能檢測和CYP2C19基因型檢測。2017年發(fā)布的《基因多態(tài)性與抗栓藥物臨床應(yīng)用專家建議》建議:CYP2C19基因型檢測主要對缺血高風(fēng)險(xiǎn)/出血高風(fēng)險(xiǎn)患者選用P2Y12抑制劑有參考價(jià)值。綜合考慮上述意見并結(jié)合中國實(shí)際情況,建議將本指導(dǎo)原則的預(yù)期適用人群限定為:
正在服用或?qū)⒁寐冗粮窭走M(jìn)行抗血小板治療的冠心病患者,主要為急性冠脈綜合征(ACS)且進(jìn)行經(jīng)皮冠狀動(dòng)脈介入治療(PCI)的患者(ACS/PCI患者)、PCI術(shù)后血栓高危且計(jì)劃調(diào)整P2Y12抑制劑治療方案的患者、缺血高風(fēng)險(xiǎn)或出血高風(fēng)險(xiǎn)患者等。其中,PCI術(shù)后血栓高?;颊咭约叭毖唢L(fēng)險(xiǎn)/出血高風(fēng)險(xiǎn)患者的人群限定可參考相關(guān)指南。
本指導(dǎo)原則所述CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測試劑是指:利用分子生物學(xué)檢測技術(shù),如聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)等,以CYP2C19基因特定序列為檢測靶標(biāo),對接受氯吡格雷治療患者的外周靜脈全血或口腔拭子等樣本基因組DNA中的CYP2C19基因多態(tài)性進(jìn)行體外定性檢測的試劑,用于氯吡格雷的用藥指導(dǎo)。
本指導(dǎo)原則的技術(shù)要求是基于熒光探針PCR方法建立的,對于其他分子生物學(xué)檢測技術(shù),可能部分要求不完全適用或本文所述技術(shù)指標(biāo)不夠全面,申請人可以根據(jù)產(chǎn)品特性對不適用部分進(jìn)行或補(bǔ)充其他的評(píng)價(jià)和驗(yàn)證,但需闡述不適用的理由,并驗(yàn)證替代方法的科學(xué)合理性。
本指導(dǎo)原則僅對用于氯吡格雷用藥指導(dǎo)的CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測試劑的相關(guān)要求進(jìn)行了說明,由于CYP2C19參與了多種不同藥物的代謝,對用于其他藥物用藥指導(dǎo)的CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測試劑,可能部分要求不完全適用或本文所述技術(shù)指標(biāo)不夠全面,申請人可以根據(jù)產(chǎn)品特性對不適用部分進(jìn)行修訂或補(bǔ)充其他的評(píng)價(jià)和驗(yàn)證。
本指導(dǎo)原則適用于進(jìn)行首次注冊申報(bào)和相關(guān)許可事項(xiàng)變更的產(chǎn)品。
二、注冊申報(bào)資料要求
(一)綜述資料
綜述資料主要包括產(chǎn)品預(yù)期用途、產(chǎn)品描述、有關(guān)生物安全性的說明、研究結(jié)果的總結(jié)評(píng)價(jià)以及國內(nèi)外同類產(chǎn)品上市情況介紹等內(nèi)容。其中,同類產(chǎn)品上市情況介紹部分應(yīng)著重從方法學(xué)、檢驗(yàn)原理、最低檢測限及被測靶標(biāo)(基因多態(tài)性位點(diǎn))等方面詳細(xì)說明申報(bào)產(chǎn)品與目前市場上已獲批準(zhǔn)的同類產(chǎn)品之間的主要區(qū)別。除此之外,還應(yīng)說明被測靶標(biāo)純合型和雜合型在中國人群的發(fā)生頻率。
若被測靶標(biāo)為新的多態(tài)性位點(diǎn),申請人還應(yīng)提交支持資料,以證明:1.攜帶新位點(diǎn)等位基因所編碼的CYP2C19酶對氯吡格雷具有預(yù)期的代謝活性;2.攜帶新位點(diǎn)等位基因的患者,其血小板功能具有預(yù)期的差異;3.接受氯吡格雷治療且攜帶新位點(diǎn)等位基因的患者表現(xiàn)出預(yù)期的主要不良心血管事件;4.根據(jù)基因型調(diào)整抗血小板治療方案后,攜帶新位點(diǎn)等位基因的患者預(yù)后獲得改善。上述資料應(yīng)為體內(nèi)臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù),如:在預(yù)期適用人群體內(nèi)進(jìn)行的酶速率研究試驗(yàn),基因型與預(yù)期適用人群的主要不良心血管事件關(guān)聯(lián)試驗(yàn),基因型導(dǎo)向的抗血小板治療試驗(yàn)等。上述資料必須包括基于中國人群的充分的臨床數(shù)據(jù)。如新位點(diǎn)可用于氯吡格雷用藥指導(dǎo)的結(jié)論已獲得行業(yè)認(rèn)可,應(yīng)同時(shí)提交證明其獲得行業(yè)認(rèn)可的支持資料。
綜述資料應(yīng)符合《體外診斷試劑注冊管理辦法》(原國家食品藥品監(jiān)督管理總局令第5號(hào),以下簡稱《辦法》)和《關(guān)于公布體外診斷試劑注冊申報(bào)資料要求和批準(zhǔn)證明文件格式的公告》(原國家食品藥品監(jiān)督管理總局公告2014年第44號(hào)),以下簡稱《44號(hào)公告》的要求。
(二)主要原材料的研究資料
CYP2C19基因多態(tài)性檢測試劑主要原材料研究資料包括主要反應(yīng)成分、質(zhì)控品及企業(yè)參考品的研究資料。
1. 此類產(chǎn)品的主要反應(yīng)成分一般包括人基因組核酸提取/純化試劑、檢測所需引物、探針、酶、dNTP、反應(yīng)緩沖液等。申請人應(yīng)提交相關(guān)原材料的選擇、制備和質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)研究資料。如為申請人自制,應(yīng)提交詳細(xì)的工藝穩(wěn)定性研究資料;如為外購,還應(yīng)提交供應(yīng)商篩選資料以及供應(yīng)商提供的原材料質(zhì)量檢定報(bào)告。
1.1 核酸提取/純化試劑(如有)的主要組成、原理介紹及相關(guān)的驗(yàn)證資料。
1.2 引物、探針
本文所述CYP2C19基因多態(tài)性檢測一般針對等位基因CYP2C19*1、CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17。申請人應(yīng)詳述引物、探針的設(shè)計(jì)原則,提供引物、探針核酸序列、模板核酸序列及兩者的對應(yīng)情況。建議設(shè)計(jì)兩套或多套引物探針以供篩選,針對待測位點(diǎn)的檢測靈敏度和特異性等進(jìn)行評(píng)價(jià),選擇最佳設(shè)計(jì),并提交詳細(xì)的篩選研究數(shù)據(jù)。同時(shí)應(yīng)針對引物、探針核酸序列及檢測靶序列進(jìn)行同源性比對,如有同源序列應(yīng)著重評(píng)價(jià)是否會(huì)有交叉反應(yīng)。
申請人應(yīng)針對選定的引物、探針原材料進(jìn)行質(zhì)量評(píng)價(jià),一般包括:分子量、純度(HPLC等)、濃度、探針熒光標(biāo)記基團(tuán)的激發(fā)波長和發(fā)射波長,以及功能性試驗(yàn)等,并依據(jù)評(píng)價(jià)結(jié)果建立合理的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。
1.3酶
CYP2C19基因多態(tài)性檢測試劑可能涉及到的酶包括DNA聚合酶和尿嘧啶DNA糖基化酶(UDG/UNG)。申請人應(yīng)針對各種酶的活性進(jìn)行驗(yàn)證,提交功能性試驗(yàn)資料,并確定酶的質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。
DNA聚合酶應(yīng)具有DNA聚合酶活性,無核酸內(nèi)切酶活性,具熱穩(wěn)定性。UDG/UNG應(yīng)具有水解尿嘧啶糖苷鍵的活性,無核酸外切酶及核酸內(nèi)切酶活性。
1.4脫氧三磷酸核苷(dNTP)
包括dATP、dCTP、dGTP、dTTP或dUTP;應(yīng)提交對其純度、濃度、保存穩(wěn)定性等的驗(yàn)證資料,以及功能性試驗(yàn)資料,并確定質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)。
2.質(zhì)控品
試劑盒的質(zhì)控體系通過設(shè)置各種試劑盒質(zhì)控品來實(shí)現(xiàn)。
CYP2C19基因多態(tài)性檢測試劑的質(zhì)控品可分別設(shè)置野生型、雜合型及純合突變型DNA樣品(至少包含常見的多態(tài)性位點(diǎn)),同時(shí)設(shè)置不含待測靶序列的空白質(zhì)控品用于交叉污染的質(zhì)控;亦可直接采用常見多態(tài)性位點(diǎn)的雜合型樣品及空白質(zhì)控品進(jìn)行質(zhì)量控制。
對于此類產(chǎn)品,一般情況下,反應(yīng)體系中野生型序列和突變型序列均有陽性反應(yīng),可以對管內(nèi)抑制導(dǎo)致的假陰性結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制,則試劑盒中可不另外設(shè)置內(nèi)標(biāo)對照;否則,應(yīng)另外設(shè)置內(nèi)標(biāo)對照。
質(zhì)控體系應(yīng)能夠?qū)z測全過程進(jìn)行有效的質(zhì)量控制,包括試劑及儀器性能、可能的擴(kuò)增反應(yīng)抑制物(管內(nèi)抑制)、交叉污染等因素造成的假陰性或假陽性結(jié)果。質(zhì)控品可采用質(zhì)?;蚺R床樣本的核酸提取液等。空白質(zhì)控品應(yīng)參與樣本核酸的平行提取。申請人應(yīng)針對質(zhì)控品原料選擇、制備、定值過程等提供詳細(xì)的研究數(shù)據(jù),并對質(zhì)控品的檢測結(jié)果做出明確的范圍要求。
3.企業(yè)參考品
企業(yè)參考品主要包括陽性參考品、陰性參考品、檢測限參考品、精密度參考品等。申請人應(yīng)提交有關(guān)企業(yè)參考品原料選擇、制備方法、基因序列確認(rèn)及檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)的研究資料,包括所用到的參考方法等。
3.1陽性參考品:可采用臨床樣本或其核酸提取液,樣本類型與待測樣本一致。應(yīng)至少包含野生型和所有多態(tài)性位點(diǎn)的雜合型樣本,同時(shí)盡量納入純合突變型樣本。對于某些稀有基因型,需要時(shí)也可采用細(xì)胞系代替。
3.2陰性參考品:應(yīng)考慮檢測特異性的評(píng)價(jià),納入同源序列交叉反應(yīng)樣本、干擾樣本等。
3.3檢測限參考品可選擇最低檢測限濃度(例如:95%檢出率水平)或接近最低檢測限濃度(例如100%檢出率水平)的臨床樣本或其核酸提取液,至少包含所有多態(tài)性位點(diǎn)的雜合型樣本。
3.4精密度參考品應(yīng)至少包括所有多態(tài)性位點(diǎn)的低濃度雜合突變型臨床樣本或其核酸提取液。
如CYP2C19基因多態(tài)性檢測試劑已有國家參考品,企業(yè)參考品的要求應(yīng)不低于國家參考品要求。
(三)主要生產(chǎn)工藝及反應(yīng)體系的研究資料
主要生產(chǎn)工藝研究資料包括工作液配制(引物、探針濃度、酶濃度、dNTP濃度、緩沖液離子濃度等)、分裝和凍干(如有)、熒光標(biāo)記等工藝過程的描述及確定依據(jù)。生產(chǎn)過程應(yīng)對關(guān)鍵參數(shù)進(jìn)行有效控制,可采用流程圖方式描述生產(chǎn)工藝,標(biāo)明關(guān)鍵工藝質(zhì)控步驟,并詳細(xì)說明該步驟的質(zhì)控方法及質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)。
反應(yīng)體系研究指最佳反應(yīng)條件的選擇確定過程,包括樣本采集預(yù)處理、樣本保存、樣本用量、試劑用量、核酸提取純化步驟(如有)、PCR反應(yīng)條件、閾值循環(huán)數(shù)(Ct值)等的確定。
不同適用機(jī)型的反應(yīng)條件如果有差異應(yīng)分別詳述。
(四)分析性能評(píng)估資料
申請人應(yīng)針對下述各項(xiàng)分析性能提交詳細(xì)的評(píng)估資料,包括試驗(yàn)方法、試驗(yàn)樣本(類型、來源、數(shù)量、處理方法、基因型和濃度確認(rèn))、試驗(yàn)可接受標(biāo)準(zhǔn)、統(tǒng)計(jì)方法、試驗(yàn)數(shù)據(jù)及結(jié)論等。有關(guān)背景信息也應(yīng)在資料中有所體現(xiàn),包括實(shí)驗(yàn)地點(diǎn)、適用儀器、試劑規(guī)格、批號(hào)等。分析性能評(píng)估的實(shí)驗(yàn)方法可以參考相關(guān)國內(nèi)或國外有關(guān)體外診斷產(chǎn)品性能評(píng)估的指導(dǎo)原則進(jìn)行。
每項(xiàng)性能評(píng)估應(yīng)盡量采用與適用樣本類型一致的臨床樣本,對于某些稀有基因型也可采用細(xì)胞系等。
如產(chǎn)品適用樣本類型不止一種,申請人應(yīng)針對不同樣本類型分別完成性能評(píng)估。
1. 核酸提取/純化性能(如有)
在進(jìn)行靶核酸檢測前,應(yīng)有適當(dāng)?shù)暮怂崽崛?純化步驟。該步驟除最大量分離出目的核酸外,還應(yīng)有相應(yīng)的純化作用,盡可能去除PCR抑制物。無論檢測試劑是否含有核酸提取/純化的組分,企業(yè)都應(yīng)結(jié)合檢測試劑的特性,對配合使用的核酸提取/純化方法的提取效率、提取核酸純度等做充分的驗(yàn)證,并評(píng)價(jià)該方法能否滿足CYP2C19基因多態(tài)性檢測試劑的要求,提供詳細(xì)的評(píng)價(jià)資料。
2. 檢測準(zhǔn)確性
建議采用若干份臨床樣本驗(yàn)證CYP2C19基因多態(tài)性試劑的檢測準(zhǔn)確性,樣本類型與產(chǎn)品適用范圍一致;樣本應(yīng)涵蓋野生型和所有多態(tài)性位點(diǎn)的雜合突變、純合突變情況,并包含不同基因組DNA濃度。對于某些基因型樣本較為稀有的情況,亦可采用細(xì)胞系代替。
3. 檢測限和可報(bào)告范圍
CYP2C19基因多態(tài)性檢測試劑的最低檢測限可定義為:在滿足一定的檢測準(zhǔn)確性和精密度的條件下,能夠檢出目標(biāo)基因的最低人基因組DNA濃度。檢測限評(píng)價(jià)建議采用臨床樣本或細(xì)胞系,并至少包含所有多態(tài)性位點(diǎn)的雜合突變型。
可采用梯度濃度的人基因組DNA樣本進(jìn)行多次重復(fù)檢測,確定適當(dāng)檢出率水平(如:95%)下的最低人基因組DNA濃度,即為最低檢測限。系列稀釋度應(yīng)能夠覆蓋大部分檢出概率區(qū)間(0~100%),可根據(jù)各濃度梯度檢測結(jié)果直接判定,也可通過概率計(jì)算或其他適當(dāng)方法進(jìn)行測算。
同時(shí),申請人亦應(yīng)評(píng)價(jià)CYP2C19基因多態(tài)性試劑可準(zhǔn)確檢出的人基因組DNA濃度上限,即適當(dāng)檢出率水平下的最高人基因組DNA濃度。
4. 分析特異性
4.1 應(yīng)針對同源性序列(例如CYP2C19的其他突變序列、CYP2C9基因序列等)進(jìn)行交叉反應(yīng)驗(yàn)證,說明交叉反應(yīng)樣本的制備方法、核酸序列確認(rèn)方法,提交詳細(xì)的驗(yàn)證資料。
4.2 應(yīng)針對可能的內(nèi)源和外源性干擾物進(jìn)行干擾試驗(yàn)研究。干擾物的選擇與所用樣本類型有關(guān),例如:全血樣本,內(nèi)源干擾物主要涉及血脂、膽紅素、血紅蛋白和白蛋白等,外源干擾物主要包括血液樣本采集可能用到的抗凝劑、常用藥物等;對于口腔拭子樣本,干擾物需考慮全血、口腔定植菌以及口腔可能接觸到的抗菌漱口液、牙膏、食物、藥物、煙草等。
干擾試驗(yàn)可通過在臨床樣本中人工添加干擾物質(zhì)的方式,評(píng)價(jià)干擾物質(zhì)對目標(biāo)基因檢測的影響,也可直接采集暴露于干擾因素后的受試者樣本,進(jìn)行干擾試驗(yàn)評(píng)價(jià)。建議申請人在每種干擾物質(zhì)的潛在最大濃度(“最差條件”)條件下進(jìn)行評(píng)價(jià);如有干擾,應(yīng)確定不產(chǎn)生干擾的最高濃度。
5. 精密度
精密度評(píng)價(jià)應(yīng)采用臨床樣本進(jìn)行試驗(yàn),試驗(yàn)操作完全按照說明書執(zhí)行,包含核酸提取/純化等樣本處理步驟。樣本應(yīng)至少涵蓋所有多態(tài)性位點(diǎn)的雜合突變型。
精密度評(píng)價(jià)需滿足如下要求:
5.1對可能影響檢測精密度的主要因素進(jìn)行驗(yàn)證,除檢測試劑(包括核酸提取/純化組分)本身外,還包括分析儀、操作者、地點(diǎn)、時(shí)間、檢測輪次、試劑批次等。
5.2設(shè)定合理的精密度評(píng)價(jià)周期,對批內(nèi)/批間、日內(nèi)/日間以及不同操作者之間的精密度進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)。如有條件,申請人應(yīng)選擇不同的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行重復(fù)實(shí)驗(yàn)以對室間重復(fù)性進(jìn)行評(píng)價(jià)。
5.3用于精密度評(píng)價(jià)的臨床樣本應(yīng)根據(jù)可報(bào)告范圍的基因組DNA濃度至少設(shè)置低濃度和中/高濃度水平。
5.4精密度指標(biāo)可設(shè)置為檢測成功率等,申請人應(yīng)對精密度指標(biāo)評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)做出合理要求。
精密度評(píng)價(jià)資料應(yīng)詳述試驗(yàn)設(shè)計(jì)、試驗(yàn)數(shù)據(jù)、統(tǒng)計(jì)分析及試驗(yàn)結(jié)果,列出有關(guān)試劑、儀器、實(shí)驗(yàn)室、人員、樣本的相關(guān)信息。
(五)陽性判斷值確定資料
對于此類試劑,陽性判斷值即為能夠獲得理想的檢測準(zhǔn)確性的臨界值(Cut-off)。建議納入一定數(shù)量的臨床樣本,涵蓋野生型和所有多態(tài)性位點(diǎn)的突變型,采用受試者工作特征(ROC)曲線的方式進(jìn)行研究。相關(guān)資料中應(yīng)詳述試驗(yàn)方案、樣本來源、樣本量、樣本入組標(biāo)準(zhǔn)及試驗(yàn)結(jié)果等。
應(yīng)針對不同樣本類型(如有)分別進(jìn)行陽性判斷值研究,明確是否有差異。
如果試劑判讀存在灰區(qū),應(yīng)解釋說明灰區(qū)范圍的確定方法。
對于某些檢測方法學(xué),陽性判斷值研究可能不適用,申請人應(yīng)說明理由。
(六)穩(wěn)定性研究資料
穩(wěn)定性研究資料主要包括申報(bào)產(chǎn)品的穩(wěn)定性研究和適用樣本的穩(wěn)定性研究兩部分。前者主要包括申報(bào)產(chǎn)品的實(shí)時(shí)穩(wěn)定性、開瓶穩(wěn)定性、復(fù)溶穩(wěn)定性、運(yùn)輸穩(wěn)定性及凍融次數(shù)限制的研究等;后者則是指適用樣本的保存條件、保存時(shí)間等方面的研究,如果包括多種樣本類型,則需分別完成相關(guān)研究。
申報(bào)產(chǎn)品實(shí)時(shí)穩(wěn)定性研究中,應(yīng)采用至少三批樣品在實(shí)際儲(chǔ)存條件下保存至成品有效期后,選取多個(gè)時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行產(chǎn)品性能評(píng)價(jià),從而確定產(chǎn)品保存條件和有效期。
樣本穩(wěn)定性研究中,如核酸提取液不一定立即進(jìn)行檢測,則還需對核酸提取液的保存條件和穩(wěn)定性進(jìn)行研究。
申請人應(yīng)提交有關(guān)穩(wěn)定性研究方案的確定依據(jù)、具體的試驗(yàn)方法及詳細(xì)的研究數(shù)據(jù)、結(jié)論。
(七)臨床試驗(yàn)
應(yīng)滿足《體外診斷試劑臨床試驗(yàn)技術(shù)指導(dǎo)原則》(原國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第16號(hào))的要求,下面僅說明本類試劑臨床試驗(yàn)中應(yīng)關(guān)注的重點(diǎn)問題。
1. 臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)
申請人應(yīng)當(dāng)選定不少于3家(含3家)臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu),按照相關(guān)規(guī)定開展臨床試驗(yàn)。申請人應(yīng)根據(jù)產(chǎn)品特點(diǎn)及預(yù)期用途,綜合不同地區(qū)人種和流行病學(xué)背景等因素選擇臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)。
2. 臨床試驗(yàn)人群
正在服用或?qū)⒁寐冗粮窭走M(jìn)行抗血小板治療的冠心病患者,主要為急性冠脈綜合征(ACS)且進(jìn)行經(jīng)皮冠狀動(dòng)脈介入治療(PCI)的患者(ACS/PCI患者)、PCI術(shù)后血栓高危且計(jì)劃調(diào)整P2Y12抑制劑治療方案的患者、缺血高風(fēng)險(xiǎn)或出血高風(fēng)險(xiǎn)患者等。其中,PCI術(shù)后血栓高?;颊咭约叭毖唢L(fēng)險(xiǎn)/出血高風(fēng)險(xiǎn)患者的人群限定可參考相關(guān)指南。
3. 臨床樣本
應(yīng)為臨床原始樣本,如靜脈抗凝全血等,不應(yīng)直接采用提取的基因組DNA進(jìn)行試驗(yàn)。臨床樣本的采集、處理、保存和提取等應(yīng)同時(shí)滿足申報(bào)產(chǎn)品說明書以及對比試劑說明書(如適用)的相關(guān)要求。
4. 臨床試驗(yàn)樣本量
如申報(bào)產(chǎn)品同時(shí)適用于靜脈全血或口腔拭子等不同基質(zhì)的樣本類型,則每種樣本類型的例數(shù)應(yīng)分別滿足法規(guī)要求。
5. 臨床檢測準(zhǔn)確性驗(yàn)證
5.1 對比試劑
5.1.1已有同類產(chǎn)品上市的申報(bào)產(chǎn)品
對于已批準(zhǔn)的CYP2C19*2(rs4244285,c.681G>A)、CYP2C19*3(rs4986893,c.636G>A)以及CYP2C19*17(rs12248560,c.-806C>T)多態(tài)性位點(diǎn),可選擇已上市同類試劑作為對比試劑。
5.1.2 無同類產(chǎn)品上市的申報(bào)產(chǎn)品
對于新的多態(tài)性位點(diǎn),可選擇基因測序作為對比方法。
5.1.3基因測序
應(yīng)提交臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)和測序機(jī)構(gòu)簽章的委托測序協(xié)議。應(yīng)對選用的測序方法做詳細(xì)介紹,應(yīng)提供以下關(guān)于測序的詳細(xì)試驗(yàn)資料,該部分資料需由臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)簽章。
5.1.3.1測序原理、測序儀型號(hào)、測序試劑及消耗品的相關(guān)信息。
5.1.3.2測序方法所用引物信息,如核酸序列、分子量、純度、功能性實(shí)驗(yàn)等資料。引物設(shè)計(jì)應(yīng)涵蓋申報(bào)產(chǎn)品擴(kuò)增的被測靶標(biāo)。
5.1.3.3 測序方法的性能驗(yàn)證,尤其是最低檢測限的確認(rèn),建議將所選測序方法與申報(bào)產(chǎn)品的性能進(jìn)行比對分析。
5.1.3.4 測序方法應(yīng)建立合理的陽性和陰性質(zhì)控,以對臨床樣本的檢測結(jié)果進(jìn)行質(zhì)量控制。
5.1.3.5 提交有代表性的樣本測序圖譜及結(jié)果分析資料。
6. 氯吡格雷指導(dǎo)用藥臨床有效性的驗(yàn)證
6.1 已有同類產(chǎn)品上市的申報(bào)產(chǎn)品
已批準(zhǔn)的CYP2C19*2(rs4244285,c.681G>A)、CYP2C19*3(rs4986893,c.636G>A)以及CYP2C19*17(rs12248560,c.-806C>T)多態(tài)性位點(diǎn),無需進(jìn)行該部分驗(yàn)證。
6.2 無同類產(chǎn)品上市的申報(bào)產(chǎn)品
6.2.1如新多態(tài)性位點(diǎn)用于氯吡格雷用藥指導(dǎo)已獲行業(yè)認(rèn)可(包括:CPIC、國內(nèi)相關(guān)指南或?qū)<夜沧R(shí)、相關(guān)藥物說明書以及臨床應(yīng)用等的認(rèn)可),且有充分的中國人群的體內(nèi)臨床數(shù)據(jù),無需進(jìn)行該部分驗(yàn)證。
6.2.2如新多態(tài)性位點(diǎn)用于氯吡格雷用藥指導(dǎo)未獲行業(yè)認(rèn)可,應(yīng)提交基于中國人群的充分的體內(nèi)臨床數(shù)據(jù),包括但不限于:
6.2.2.1新的多態(tài)性位點(diǎn)等位基因編碼的CYP2C19酶對氯吡格雷的代謝動(dòng)力學(xué)驗(yàn)證資料。
6.2.2.2血小板功能檢測。比較不同基因型患者血小板功能的差異。
6.2.2.3基因型與主要不良心血管事件關(guān)聯(lián)性的體內(nèi)臨床試驗(yàn)。
6.2.2.4基因型可指導(dǎo)氯吡格雷用藥的有效性證據(jù)。
6.2.3 需要強(qiáng)調(diào)的是,對于6.2所述申報(bào)產(chǎn)品(包括6.2.1和6.2.2),申請人應(yīng)在臨床試驗(yàn)資料部分提交聲稱的新多態(tài)性位點(diǎn)已獲行業(yè)認(rèn)可的相關(guān)資料以及基于中國人群的充分的體內(nèi)臨床數(shù)據(jù)等,以證明申報(bào)產(chǎn)品可指導(dǎo)氯吡格雷用藥。
7. 臨床試驗(yàn)方法、數(shù)據(jù)及統(tǒng)計(jì)分析
7.1應(yīng)在臨床試驗(yàn)方案或報(bào)告中描述申報(bào)產(chǎn)品和對比試劑/方法的試驗(yàn)方法。
7.2臨床試驗(yàn)原始數(shù)據(jù)應(yīng)以列表方式表示,包括申報(bào)產(chǎn)品的結(jié)果、對比試劑/方法的結(jié)果、臨床診斷、年齡、性別以及是否進(jìn)行PCI等。
7.3應(yīng)總結(jié)野生型、各多態(tài)性位點(diǎn)雜合型和純合突變型的例數(shù),以交叉四格表分別總結(jié)兩種試劑對各多態(tài)性位點(diǎn)的定性檢測結(jié)果,并分別計(jì)算各多態(tài)性位點(diǎn)基因型的陽性符合率、陰性符合率、總體符合率及其95%置信區(qū)間,對定性結(jié)果分別進(jìn)行四格表卡方或kappa檢驗(yàn),以驗(yàn)證兩種試劑檢測結(jié)果的一致性。
7.4 結(jié)果差異樣本的驗(yàn)證
在數(shù)據(jù)收集過程中,對于兩種試劑檢測結(jié)果不一致的樣本,應(yīng)采用合理方法進(jìn)行復(fù)核,并對差異原因進(jìn)行分析。如無需復(fù)核,應(yīng)說明理由。
8. 臨床試驗(yàn)方案
各臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)的方案設(shè)置應(yīng)基本一致,且保證在整個(gè)臨床試驗(yàn)過程中遵循預(yù)定的方案,不可隨意改動(dòng)。整個(gè)試驗(yàn)過程應(yīng)在臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)室內(nèi)并由本實(shí)驗(yàn)室的技術(shù)人員操作完成,申報(bào)單位的技術(shù)人員除進(jìn)行必要的技術(shù)指導(dǎo)外,不得隨意干涉實(shí)驗(yàn)進(jìn)程。
試驗(yàn)方案應(yīng)確定嚴(yán)格的入選/排除標(biāo)準(zhǔn),任何已入選的樣本被排除出臨床試驗(yàn)都應(yīng)記錄在案并明確說明原因。在試驗(yàn)操作過程和結(jié)果判定時(shí)應(yīng)采用盲法以保證試驗(yàn)結(jié)果的客觀性。各臨床試驗(yàn)機(jī)構(gòu)選用的對比試劑/方法應(yīng)保持一致,以便進(jìn)行合理的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。另外,申報(bào)產(chǎn)品的樣本類型不應(yīng)超越對比試劑/方法對樣本類型的要求。
9. 臨床試驗(yàn)報(bào)告
應(yīng)對試驗(yàn)的整體設(shè)計(jì)及各個(gè)關(guān)鍵點(diǎn)給予清晰、完整的闡述,應(yīng)該對整個(gè)臨床試驗(yàn)實(shí)施過程、結(jié)果分析、結(jié)論等進(jìn)行條理分明的描述,并應(yīng)包括必要的數(shù)據(jù)和統(tǒng)計(jì)分析方法。
(八)產(chǎn)品技術(shù)要求
產(chǎn)品技術(shù)要求應(yīng)符合《辦法》《44號(hào)公告》和《醫(yī)療器械產(chǎn)品技術(shù)要求編寫指導(dǎo)原則》(原國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第9號(hào))的相關(guān)要求。該類產(chǎn)品作為三類體外診斷試劑,應(yīng)將主要原材料、生產(chǎn)工藝及半成品要求等內(nèi)容作為附錄附于技術(shù)要求正文后。
如果申報(bào)產(chǎn)品已有相應(yīng)的國家/行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)發(fā)布,則企業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的要求不得低于上述標(biāo)準(zhǔn)要求。
(九)產(chǎn)品檢驗(yàn)報(bào)告
根據(jù)《辦法》的要求,第三類體外診斷試劑申請注冊時(shí)應(yīng)提交連續(xù)三個(gè)生產(chǎn)批次樣品的檢驗(yàn)報(bào)告。如有國家標(biāo)準(zhǔn)品/參考品的檢驗(yàn)項(xiàng)目,應(yīng)在產(chǎn)品檢驗(yàn)時(shí)采用。
(十)產(chǎn)品說明書
產(chǎn)品說明書應(yīng)滿足《體外診斷試劑說明書編寫指導(dǎo)原則》(原國家食品藥品監(jiān)督管理總局通告2014年第17號(hào))的要求,產(chǎn)品說明書的所有內(nèi)容均應(yīng)與申請人提交的注冊申報(bào)資料中的相關(guān)研究結(jié)果保持一致。下面對CYP2C19藥物代謝酶基因多態(tài)性檢測試劑說明書的重點(diǎn)內(nèi)容進(jìn)行闡述。
1.【預(yù)期用途】 應(yīng)至少包括以下幾部分內(nèi)容:
1.1本產(chǎn)品用于體外定性檢測人體xx樣本中的yy基因多態(tài)性,可檢測的多態(tài)性類型包括aa,本產(chǎn)品用于氯吡格雷的用藥指導(dǎo)。本產(chǎn)品不能預(yù)測患者對氯吡格雷的應(yīng)答情況,僅能輔助醫(yī)生確定氯吡格雷治療策略。本產(chǎn)品檢測結(jié)果僅供臨床參考,不應(yīng)作為患者是否用藥的唯一依據(jù),臨床醫(yī)生應(yīng)結(jié)合患者病情、療效及其他實(shí)驗(yàn)室檢測指標(biāo)等對本產(chǎn)品的檢測結(jié)果進(jìn)行綜合判斷。
1.2介紹被測靶標(biāo)(基因多態(tài)性位點(diǎn)),明確各多態(tài)性雜合型和純合型的臨床發(fā)生頻率,明確可進(jìn)行氯吡格雷用藥指導(dǎo)的適用人群,明確不同基因型與氯吡格雷的關(guān)系。
2.【主要組成成分】
2.1說明試劑盒包含組分的名稱、數(shù)量、比例或濃度等信息,說明不同批號(hào)試劑盒中各組分是否可以互換。
2.2試劑盒中不包含但對該項(xiàng)檢測必須的組分,企業(yè)應(yīng)列出相關(guān)試劑/耗材的名稱、貨號(hào)及其他相關(guān)信息。
2.3如果試劑盒中不包含用于核酸提取純化的試劑組分,則應(yīng)在此注明經(jīng)過驗(yàn)證后配合使用的商品化核酸提取純化試劑盒的生產(chǎn)企業(yè)、產(chǎn)品名稱以及產(chǎn)品貨號(hào)和醫(yī)療器械備案號(hào)(如有)等詳細(xì)信息。
3.【檢驗(yàn)原理】
3.1對試劑盒的被測靶標(biāo)進(jìn)行詳細(xì)描述(基因位置、多態(tài)性位點(diǎn)及相關(guān)特征等),對試劑盒所用探針、引物、多態(tài)性的判定終點(diǎn)等進(jìn)行詳細(xì)的介紹;對不同樣本反應(yīng)管組合、質(zhì)控品設(shè)置及熒光信號(hào)檢測原理等進(jìn)行介紹。
3.2試劑盒技術(shù)原理的詳細(xì)介紹,建議結(jié)合適當(dāng)圖示進(jìn)行說明。如反應(yīng)體系中添加了相關(guān)的防污染組分(如UNG酶),也應(yīng)對其作用機(jī)理進(jìn)行適當(dāng)介紹。
4.【儲(chǔ)存條件及有效期】
說明試劑盒的效期穩(wěn)定性等,應(yīng)明確具體的儲(chǔ)存條件及有效期等信息。
5.【樣本要求】
樣本的采集、處理、運(yùn)送和保存:明確樣本采集、核酸提取純化前的處理(如離心和洗滌等)、保存條件及期限(短期和長期)以及運(yùn)送條件等。冷藏/冷凍樣本檢測前是否需要恢復(fù)至室溫,凍融次數(shù)的限制等。
6.【適用儀器】
所有適用的儀器型號(hào),并提供與儀器有關(guān)的重要信息以指導(dǎo)用戶操作。
7.【檢驗(yàn)方法】
詳細(xì)說明實(shí)驗(yàn)操作的各個(gè)步驟,包括:
7.1實(shí)驗(yàn)條件:實(shí)驗(yàn)室分區(qū)、實(shí)驗(yàn)環(huán)境的溫度、濕度和空調(diào)氣流方向控制等注意事項(xiàng)。
7.2試劑配制方法和注意事項(xiàng)。
7.3詳述核酸提取純化的條件、步驟及注意事項(xiàng)(如適用),對核酸提取純化環(huán)節(jié)進(jìn)行合理的質(zhì)量控制,明確提取核酸的濃度純度等質(zhì)量要求。
7.4擴(kuò)增反應(yīng)前準(zhǔn)備:加樣體積、順序等。
7.5 PCR各階段的溫度、時(shí)間設(shè)置、循環(huán)數(shù)設(shè)置或相應(yīng)的自動(dòng)化檢測程序及相關(guān)注意事項(xiàng)。
7.6儀器設(shè)置(如適用):特殊參數(shù)、探針的熒光素標(biāo)記情況、對待測多態(tài)性及其他質(zhì)控品的熒光通道選擇等。
8.【檢驗(yàn)結(jié)果的解釋】
結(jié)合質(zhì)控品、樣本管檢測結(jié)果以及多態(tài)性類型與氯吡格雷表型之間的關(guān)系,以列表形式詳述所有可能出現(xiàn)的結(jié)果及相應(yīng)的解釋。如存在檢測灰區(qū),應(yīng)詳述對于灰區(qū)結(jié)果的處理方式。
9.【檢驗(yàn)方法的局限性】
9.1申報(bào)產(chǎn)品僅對下述多態(tài)性類型xx進(jìn)行了驗(yàn)證。
9.2有關(guān)假陰性結(jié)果的可能性分析
9.2.1不合理的樣本采集、運(yùn)送及處理或核酸過度降解均有可能導(dǎo)致假陰性結(jié)果。
9.2.2未經(jīng)驗(yàn)證的其他干擾或PCR抑制因子等可能會(huì)導(dǎo)致假陰性結(jié)果(如有)。
10.【產(chǎn)品性能指標(biāo)】簡述以下性能指標(biāo):
10.1最低檢測限:簡單介紹最低檢測限的確定方法,并明確最低檢測限結(jié)果。
10.2陽性/陰性參考品符合率。
10.3精密度:簡單介紹精密度的確定方法,并明確精密度結(jié)果。
10.4分析特異性
10.4.1交叉反應(yīng)驗(yàn)證:同源性序列等交叉反應(yīng)驗(yàn)證。
10.4.2干擾物質(zhì)驗(yàn)證:樣本中常見干擾物質(zhì)對檢測結(jié)果的影響。
10.5對比試驗(yàn)研究(如有):簡要介紹對比試劑(方法)的信息、所采用的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法及統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果。
11.【注意事項(xiàng)】應(yīng)至少包括以下內(nèi)容:
11.1如該產(chǎn)品含有人源或動(dòng)物源性物質(zhì),應(yīng)給出具有潛在感染性的警告。
11.2臨床實(shí)驗(yàn)室應(yīng)嚴(yán)格按照《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室管理辦法》(衛(wèi)辦醫(yī)政發(fā)〔2010〕194號(hào)或現(xiàn)行有效版本)等有關(guān)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室、臨床基因擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)室的管理規(guī)范執(zhí)行。
三、起草單位
國家藥品監(jiān)督管理局醫(yī)療器械技術(shù)審評(píng)中心。
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